网上阅卷系统在教学综合评价中的应用包括：学生评教师、领导评教师、教师互评。

　　例如学生评教师：学校对任课教师的教学质量评价，可根据具体情况设置评价项目(如：教学态度、教学方法、业务素质、纪律考勤等)，让学生给予每个教师涂卡打分，通过网上阅卷系统给予教师公正、客观、的分值。由于应用网上阅卷系统可自行设定各个评价项目，故使得群体对个人的量化评价更加明朗、客观、准确。能避免被评价为落后教师误认学校领导任人唯亲、优亲厚友而造成的矛盾，真正实现领导、教师心平气和，激励先进，鞭策后进。  

　　网上阅卷系统还能应用于素质教育中：如对学生的心理测试、身体测试、德育测试、体育达标测试、课外活动测试等方面可以应用网上阅卷系统读出测评结果。  

　　网上阅卷系统能应用于校园网络中：开展信息技术教育，首要的任务之一是建立校园网，它需录入很多的学校管理信息，应用网上阅卷系统将信息进入校园网比人工敲键盘录入速度能提高数百倍。